http://dl.gi.de/handle/20.500.12116/16059 2026-07-23T06:21:49Z http://dl.gi.de/handle/20.500.12116/9675 Algorithmische Systembiologie mit Petrinetzen – Von qualitativen zu quantitativen Systemmodellen Birzele, Fabian; Csaba, Gergely; Erhard, Florian; Friedel, Caroline; Küffner, Robert; Petri, Tobias; Windhager, Lukas; Zimmer, Ralf Die algorithmische Systembiologie ist ein aktuelles Teilgebiet der Bioinformatik. Petrinetze [28] werden seit Jahrzehnten für die Modellierung von Systemen und seit ca. 15 Jahren auch in der netzwerk-orientierten Bioinformatik [17, 27] verwendet. In der algorithmischen Systembiologie werden Petrinetze einerseits zur Repräsentation von biologischem Wissen in Form von qualitativen Netzwerkmodellen und andererseits für die Analyse ihrer dynamischen Eigenschaften und ihre quantitative Simulation eingesetzt. Die Auswahl relevanter Teilnetze aus großen qualitativen Netzen und ihre Umsetzung in quantitative Modelle erfordern neue methodische Ansätze. 2009-01-01T00:00:00Z http://dl.gi.de/handle/20.500.12116/9674 Gewissensbits – Wie würden Sie urteilen? 2009-01-01T00:00:00Z http://dl.gi.de/handle/20.500.12116/9664 Analyse und Visualisierung biologischer Netzwerke Schreiber, Falk Moderne Analysemethoden ermöglichen es, die elementaren Bausteine biologischer Systeme im großen Umfang zu bestimmen. Sie sind damit Grundlage für einen ganzheitlichen Ansatz der Untersuchung biologischer Systeme im Sinne der Systembiologie, um aufbauend auf den einzelnen Elementen und ihren Interaktionen das Gesamtsystem zu verstehen. Netzwerke spielen dabei eine entscheidende Rolle, da sie ein geeignetes Medium zur Integration der unterschiedlichen Daten darstellen. Durch die Entwicklung neuer Analyse- und Visualisierungsmethoden für biologische Netzwerke kann die Informatik wesentlich zum besseren Verständnis der komplexen Prozesse in Lebewesen beitragen. Dieser Artikel gibt einen Überblick über das Thema und zeigt beispielhaft Anwendungen. 2009-01-01T00:00:00Z http://dl.gi.de/handle/20.500.12116/9666 Bioinformatische Unterstützung der Auswahl von HIV-Therapien Lengauer, Thomas; Altmann, André; Thielen, Alexander AIDS ist eine der wesentlichen Bedrohungen für die Menschheit unter den heutigen Infektionskrankheiten. Die Krankheit verursacht weltweit Millionen Todesfälle jährlich. 2009-01-01T00:00:00Z